南京治疗肝癌比较专业的医院有江苏省人民医院、南京鼓楼医院、东部战区总医院、东南大学附属中大医院、南京市第二医院、江苏省肿瘤医院等医疗机构。这些医院均设有独立的肝胆疾病诊疗中心，配备现代化诊疗设备，在肝癌的早期筛查、治疗和综合管理方面形成特色。其中江苏省人民医院肝胆中心年开展肝癌介入手术超2000例，南京鼓楼医院肝胆外科常规开展三维可视化手术规划，东部战区总医院在肝癌免疫治疗领域取得多项科研成果。
江苏省人民医院
江苏省人民医院（南京医科大学第一附属医院）肝胆中心是国家临床重点专科，设有肝脏肿瘤介入治疗中心、射频消融治疗室及生物治疗实验室。该院配备3.0T磁共振引导超声系统、256排CT等设备，常规开展经肝动脉化疗栓塞术（TACE）、微波消融等介入治疗技术。中心建立肝癌多学科诊疗（MDT）体系，实施个体化治疗方案，针对中晚期肝癌患者开展靶向药物联合介入治疗，五年生存率处于国内水平。2019年完成省内首例钇-90微球放射栓塞治疗，为难治性肝癌提供新选择。
南京鼓楼医院
南京鼓楼医院肝胆外科为国家重点学科培育点，拥有达芬奇手术机器人、荧光腹腔镜等设备。科室在解剖性肝切除、ALPPS分阶段肝切除等术式上形成技术优势，年完成肝癌术400余例。针对复发性肝癌建立再手术评估体系，开展术中超声引导下的切除。2021年引进虚拟现实手术规划系统，实现肿瘤三维重建与手术路径模拟。该院参与制定《原发性肝癌诊疗规范》，在肝癌转化治疗领域率先开展PD-1抑制剂联合TACE的临床研究，相关成果发表于国际期刊。
东部战区总医院
东部战区总医院肿瘤内科联合肝胆外科组建肝癌诊疗中心，开展放射性粒子植入、纳米刀消融等微创技术。医院配备PET-MRI融合成像系统，实现肝癌的早期分子影像诊断。针对晚期肝癌患者建立包括介入治疗、靶向治疗、免疫治疗的综合治疗模式，2020年开展CAR-T细胞治疗临床试验。中心设有华东地区大的肿瘤生物样本库，在肝癌基因组学研究方面取得突破，发现多个与治疗反应相关的生物标志物。近年来承担国家重大科研专项3项，获军队医疗成果一等奖2项。
东南大学附属中大医院
东南大学附属中大医院介入与血管外科在肝癌介入治疗领域具有显著优势，年完成TACE手术1500余例。科室配备双平板DSA系统，可实施载药微球栓塞、放射性栓塞等介入治疗。针对门静脉癌栓患者创新性开展经颈静脉肝内门体分流术（TIPS）联合栓塞治疗，有效改善患者生存质量。医院建立肝癌全程管理数据库，运用人工智能技术进行预测和复发监测，相关算法获国家发明专利。
南京市第二医院
南京市第二医院作为江苏省传染病定点医疗机构，在乙肝相关性肝癌诊治方面形成特色。肝病科联合影像科开展超声造影引导下穿刺活检，诊断准确率达98%以上。医院实施抗病毒治疗与肝癌治疗同步干预策略，建立肝癌复发预警模型。配备高强度超声（HIFU）肿瘤治疗系统，对不适合手术的早期肝癌开展无创治疗。2022年建成肝癌防治一体化中心，整合肝病预防、早期筛查、治疗和康复管理全流程服务。
