南京治疗肾结石比较好的医院有江苏省人民医院、南京鼓楼医院、东部战区总医院、南京市第一医院、南京医科大学第二附属医院等。其中江苏省人民医院泌尿外科设备，拥有多种微创碎石技术；南京鼓楼医院结石诊疗中心年手术量超2000例；东部战区总医院在复杂肾结石治疗方面经验丰富。
1、江苏省人民医院
江苏省人民医院泌尿外科是重点专科，配备有瑞士第四代EMS碎石清石系统、钬激光等设备。该科室开展经皮肾镜、输尿管软镜等微创手术，其中超微通道经皮肾镜技术创伤更小。针对不同大小和位置的结石，科室制定个性化治疗方案，术后并发症发生率低于行业平均水平。医院还设有结石成分分析实验室，为预防复发提供科学依据。
2、南京鼓楼医院
南京鼓楼医院泌尿外科结石病区年收治患者量居华东地区前列，拥有独立的结石诊疗中心。科室引进了德国多尼尔体外冲击波碎石机、Olympus电子输尿管软镜等设备，可开展三维定位体外碎石术。针对铸型结石等复杂病例，采用多镜联合手术方式，结石清除率达到95%以上。医院还建立了结石防治随访体系，提供饮食指导和代谢评估服务。
3、东部战区总医院
东部战区总医院泌尿外科在军地患者中享有较高声誉，特别擅长处理合并解剖异常的复杂肾结石。科室配备有超声联合X线双定位碎石系统，可实施经皮肾镜手术。针对鹿角形结石等疑难病例，创新应用斜仰卧截石位手术方式，大幅提术性。医院还开展结石预防门诊，通过24小时尿液成分分析制定预防方案。
4、南京市第一医院
南京市第一医院泌尿外科是南京市重点专科，拥有独立的结石病区。科室常规开展输尿管镜碎石取石术，对于2cm以下结石可实现日间手术。医院引进了新一代气压弹道碎石系统，配合超声吸附装置实现高效清石。针对儿童肾结石患者，科室采用改良的小儿输尿管镜技术，具有创伤小、恢复快的特点。
5、南京医科大学第二附属医院
南京医科大学第二附属医院泌尿外科在结石代谢评估方面具有特色，设有专门的结石分析实验室。科室采用红外光谱法进行结石成分检测，准确率超过98%。在手术治疗方面，医院配备有组合式输尿管软镜，可同时进行碎石和取石操作。针对感染性结石患者，科室建立了个体化的抗感染治疗方案，有效降低复发风险。
