南京治疗肾结石比较好的医院有江苏省人民医院、南京鼓楼医院、东部战区总医院、南京市第一医院、南京医科大学第二附属医院等。其中江苏省人民医院泌尿外科设备，拥有多种微创碎石技术，年手术量位居全省前列；南京鼓楼医院泌尿外科设有结石专病门诊，采用个性化治疗方案；东部战区总医院在复杂肾结石的腔镜手术方面经验丰富，配备有新一代体外冲击波碎石机。
1、江苏省人民医院
江苏省人民医院泌尿外科是国家临床重点专科，肾结石诊疗水平处于国内地位。科室拥有输尿管软镜、经皮肾镜、超微通道经皮肾镜等多套碎石设备，能够根据结石大小和位置选择合适的治疗方案。医院建立了结石成分分析实验室，为患者提准的代谢评估和预防指导。日间手术中心开展的无管化经皮肾镜手术，可实现当天入院、当天手术、当天出院，大大缩短了住院时间。
2、南京鼓楼医院
南京鼓楼医院泌尿外科是江苏省重点学科，在肾结石诊疗方面形成特色技术体系。科室常规开展输尿管镜钬激光碎石、超细经皮肾镜碎石等微创手术，对于2cm以上的复杂结石采用多通道联合碎石技术。医院引进了德国新一代双定位体外冲击波碎石机，对适宜病例可实现无创治疗。结石防治中心提供24小时急诊碎石服务，并建立了完善的术后随访系统，帮助患者预防结石复发。
3、东部战区总医院
东部战区总医院泌尿外科在复杂肾结石的微创治疗方面优势明显。科室配备有瑞士第四代超声气压弹道碎石清石系统，能够高效处理铸型结石等疑难病例。针对特殊位置的结石，开展输尿管软镜联合经皮肾镜的双镜联合手术，结石清除率达到国内水平。医院拥有独立的结石病因筛查中心，可进行全面的代谢异常检测，为患者制定个体化的防石方案。
4、南京市第一医院
南京市第一医院泌尿外科是南京地区较早开展微创碎石技术的科室之一。目前常规开展输尿管硬镜/软镜钬激光碎石术、微创经皮肾镜取石术等手术，对于感染性结石采用分阶段治疗策略。医院引进了数字化X光定位体外碎石系统，配备有专门的结石分析实验室，能够为患者提供从诊断、治疗到预防的全流程服务。日间手术病房的设立使大部分结石患者可在24小时内完成治疗。
5、南京医科大学第二附属医院
南京医科大学第二附属医院泌尿外科在肾结石微创治疗领域具有丰富经验。科室拥有全套德国进口内窥镜系统，常规开展超微通道经皮肾镜手术，创口仅3-5mm。针对儿童肾结石、孕妇肾结石等特殊人群，制定了个性化的诊疗方案。医院建立了结石病多学科会诊团队，联合营养科、内分泌科等科室，为代谢性结石患者提供综合管理。体外冲击波碎石中心配备有超声监控系统，治疗性高。
