南京治疗小儿抽动症比较好的医院有南京脑科医院、南京儿童医院、江苏省人民医院、东南大学附属中大医院、南京市第一医院。这些医院在小儿神经系统疾病诊疗方面具有丰富经验，配备专业儿科神经科，能够为患儿提供全面评估和个性化治疗方案。
1.南京脑科医院
南京脑科医院儿童心理卫生研究中心是江苏省重点专科，设有专门的小儿神经行为门诊。医院采用多学科协作模式，结合药物治疗、行为干预和家庭指导的综合。配备视频脑电图监测系统、经颅磁刺激仪等设备，可对抽动症进行分型和严重程度评估。医院定期开展患儿家长课堂，帮助家庭掌握科学的疾病管理方法。
2.南京儿童医院
南京儿童医院神经内科年接诊小儿抽动症病例超千例，建立了一套规范的诊疗流程。医院开展抽动障碍专项评估，包括耶鲁综合抽动严重程度量表测评、共患病筛查等。治疗方面注重药物与非药物的结合，提供认知行为治疗、生物反馈训练等特色项目。医院设有儿童康复中心，针对共患多动症或学习困难的患儿提供个性化康复方案。
3.江苏省人民医院
江苏省人民医院儿科神经专科开展小儿抽动症诊疗已有20余年历史。医院采用国际诊疗标准，建立从初诊、评估到长期随访的完整体系。特色在于对难治性病例的诊疗，拥有重复经颅磁刺激、神经调控技术等治疗手段。医院参与多项科研项目，在抽动症发病机制研究方面取得重要成果，能够为患儿提供前沿治疗方案。
4.东南大学附属中大医院
东南大学附属中大医院儿科神经专业组在小儿运动障碍疾病诊疗方面具有优势。医院开展抽动症的全病程管理，从症状识别到青春期过渡期管理形成完整闭环。特色项目包括神经心理评估、家庭环境干预指导等，注重患儿社会功能的恢复。医院与学校建立合作机制，帮助解决患儿在校期间的特殊需求。
5.南京市第一医院
南京市第一医院儿科神经专科设有抽动症专病门诊，采用标准化评估工具进行病情监测。治疗上注重个体化用药方案的制定，建立药物和不良反应监测体系。医院开展家长支持小组活动，提供疾病知识培训和心理支持。针对共患强迫症、焦虑症的患儿，医院可组织多科联合会诊，制定综合干预计划。
