秋季腹泻一般会传染，主要由轮状病毒、诺如病毒等病原体引起，可通过粪口途径或接触传播。患者需做好隔离与消毒措施。
轮状病毒是婴幼儿秋季腹泻的主要病原体，病毒通过感染者粪便排出后，可能污染食物、水源或物体表面。健康人群接触被污染的物体后未洗手，再经口摄入病毒可导致感染。病毒在环境中存活时间较长，幼儿园、托儿所等集体机构易发生聚集性传播。患者发病初期传染性强，粪便中病毒载量高，症状消退后仍可能排毒数日。
诺如病毒则多见于成人及学龄儿童，除粪口传播外，呕吐物形成的飞沫也可能造成空气传播。病毒变异速度快，人群普遍易感，可在养老院、学校等场所引起暴发疫情。感染者处理食物时未规范洗手，可能导致食源性传播。免疫功能低下者感染后症状持续时间更长，排毒期可达2-3周。
患者应单独使用餐具及卫生用品，粪便及呕吐物需用含氯消毒剂处理。照顾者接触患者前后需用肥皂流水洗手，被污染衣物应煮沸消毒。发病期间避免制作食物或接触婴幼儿，症状消失后继续隔离1-2天。接种轮状病毒疫苗可有效预防婴幼儿重症感染，但需在出生后规定时间内完成接种程序。
