鱼肝油不适合过敏体质者、高钙血症患者、维生素A或D过量者、肝功能异常者及孕妇。鱼肝油主要含维生素A和D，过量摄入可能导致中毒或加重基础疾病。
对鱼类或鱼肝油成分过敏的人群食用后可能出现皮肤瘙痒、红肿、呼吸困难等过敏反应。严重时可引发过敏性休克，需立即就医。建议过敏体质者选择植物来源的维生素补充剂。
鱼肝油中的维生素D会促进钙吸收，加重高钙血症症状如多尿、心律失常、肾结石等。此类患者应监测血钙水平，避免同时服用钙剂和维生素D制剂。
长期超量摄入鱼肝油可能导致维生素A或D中毒。维生素A过量表现为头痛、肝损伤；维生素D过量会引起血钙升高、血管钙化。日常饮食均衡者通常无须额外补充。
肝脏代谢障碍会影响脂溶性维生素的分解排泄，服用鱼肝油可能加重肝脏负担。肝硬化或肝炎患者应在医生指导下调整剂量，避免维生素A在体内蓄积。
妊娠早期过量维生素A可能致畸，晚期过量可能影响胎儿骨骼发育。孕妇如需补充应选择专为孕期设计的复合维生素，避免单独服用高剂量鱼肝油。
健康人群服用鱼肝油建议每日不超过1-2粒，避免与含维生素A/D的复合制剂同服。出现恶心、食欲减退等不适时应停用。儿童、老人及慢性病患者需在医生或营养师指导下调整剂量，定期检测相关指标。日常可通过食用深海鱼、蛋黄、乳制品等食物天然获取相关营养素。
