细菌性龟头炎和真菌性龟头炎的主要区别在于致病微生物、症状表现及治疗药物。细菌性龟头炎通常由葡萄球菌、链球菌等引起，表现为红肿、脓性分泌物；真菌性龟头炎多由白色念珠菌感染导致，伴随白色豆腐渣样分泌物和剧烈瘙痒。
细菌性龟头炎常见病原体为大肠埃希菌、金黄色葡萄球菌等革兰氏阴性或阳性菌，多因包皮过长或卫生不良导致细菌滋生。真菌性龟头炎主要由念珠菌属真菌感染，尤其常见于糖尿病患者、长期使用抗生素或免疫力低下者，可通过性接触传播。
细菌感染时龟头及包皮出现弥漫性红肿，可有黄色脓性分泌物伴疼痛，严重时形成溃疡。真菌感染特征为龟头表面覆盖白色凝乳状分泌物，周围散在红色丘疹或糜烂面，瘙痒明显且易反复发作，可能合并包皮皲裂。
细菌性龟头炎需通过分泌物涂片革兰染色或细菌培养确诊，可见大量中性粒细胞和细菌。真菌性龟头炎需氢氧化钾溶液镜检发现假菌丝或孢子，必要时进行真菌培养，血糖检测有助于排查糖尿病诱因。
细菌感染可外用莫匹罗星软膏或夫西地酸乳膏，严重时口服头孢克洛胶囊。真菌感染需使用克霉唑乳膏或硝酸咪康唑散，反复发作者可口服氟康唑胶囊。两者均需保持局部清洁干燥，避免搔抓。
细菌性龟头炎预防需每日清洗包皮垢，包茎者建议环切手术。真菌性龟头炎应控制血糖，避免滥用抗生素，性伴侣需同步治疗。两类患者均需选择透气棉质内裤，避免使用刺激性洗剂。
无论细菌或真菌感染，出现龟头红肿、分泌物异常时应及时就诊，避免自行用药导致耐药或病情加重。治疗期间禁止性生活，饮食需清淡并补充维生素B族增强免疫力。合并包皮过长的患者感染控制后，可考虑包皮环切术降低复发风险。
