九价和四价宫颈癌疫苗的主要区别在于预防的HPV病毒亚型数量及适用年龄范围，九价可预防9种高危型HPV（包括四价覆盖的6/11/16/18型），四价仅覆盖4种；九价国内适用年龄为16-26岁，四价为20-45岁。
九价疫苗可预防HPV16/18/31/33/45/52/58七种高危致癌型及6/11两种低危致疣型，对宫颈癌的总体预防率超过90%；四价疫苗仅覆盖HPV16/18两种高危型和6/11低危型，对宫颈癌预防率约70%。九价新增的31/33/45/52/58型在亚洲女性感染率较高，能显著降低阴道癌、外阴癌等关联癌症风险。
九价疫苗在中国大陆获批的接种年龄为16-26岁女性，超过26岁需选择四价或二价；四价疫苗适用20-45岁更广泛人群。两种疫苗均需在6个月内完成3剂接种，但九价对未发生过性行为者的保护效果更优。妊娠期女性均禁止接种，哺乳期女性接种需医生评估。
临床数据显示九价疫苗诱导的抗体滴度更高，针对HPV16/18的抗体水平是四价的5-8倍，对52/58型的抗体持续时间可达10年以上；四价疫苗对16/18型的保护作用至少维持8-10年。两种疫苗均未显示需加强接种的证据，但长期保护效果仍需持续监测。
九价与四价均常见注射部位疼痛、红肿等局部反应，全身反应如发热、头痛发生率均低于10%。九价因抗原成分更多，肌肉酸痛发生率略高（约15%对比四价的12%），但严重过敏反应概率均小于0.1%。两种疫苗的性数据均通过国际多中心临床试验验证。
26岁以下女性优先推荐九价以获得更全面保护；26岁以上可选择四价或二价疫苗。已接种四价者无须补种九价，但若首剂四价接种未满1年且年龄未超26岁，可咨询医生更换为九价。两种疫苗均不能治疗已感染的HPV病毒，接种后仍需定期进行宫颈癌筛查。
无论选择哪种疫苗，接种前后应避免剧烈运动，观察30分钟无过敏反应方可离开。接种后2-3天可能出现乏力或低热，可适当补充维生素C并保证休息。建议将疫苗接种纳入年度健康管理计划，配合定期妇科检查、保持单一性伴侣、使用避孕套等措施综合预防HPV感染。已有性生活的女性接种后仍需坚持每3年进行一次TCT联合HPV检测。
