四阶和九价宫颈癌疫苗的主要区别在于预防的HPV病毒亚型数量及覆盖范围。四价疫苗可预防HPV16、18、6、11四种亚型，九价疫苗则覆盖HPV16、18、31、33、45、52、58、6、11九种亚型，提供更广泛的保护。
四价宫颈癌疫苗针对HPV16和18两种高危亚型，这两种亚型与约70%的宫颈癌相关，同时覆盖HPV6和11两种低危亚型，可预防疣。九价疫苗在四价基础上新增了HPV31、33、45、52、58五种高危亚型，将宫颈癌预防率提升至约90%，并同样覆盖HPV6和11。
四价疫苗在中国大陆获批适用于9-45岁女性，而九价疫苗的适用年龄在不同地区存在差异，中国大陆目前批准用于16-26岁女性，部分国家或地区扩展至9-45岁。年龄限制主要基于临床试验数据及当地卫生政策。
两种疫苗均需接种三剂，四价疫苗的常规接种程序为第0、2、6个月，九价疫苗为第0、2、6个月或第0、1、6个月。免疫功能低下者可能需要调整接种方案。两种疫苗均采用肌肉注射方式，通常选择上臂三角肌。
四价疫苗对HPV16/18相关宫颈癌前病变的保护效力约为98%，对HPV6/11引起的疣保护效力接近90%。九价疫苗对新增五种高危型HPV相关癌前病变的保护效力超过95%，且对原有四种亚型的保护效果与四价相当。
两种疫苗的常见不良反应相似，包括注射部位疼痛、红肿、发热、头痛等，多为轻度至中度且短期内自行缓解。九价疫苗因覆盖更多抗原成分，局部反应发生率略高于四价，但严重过敏反应均罕见。接种后需观察30分钟以监测急性过敏反应。
无论选择四价还是九价疫苗，接种后仍需定期进行宫颈癌筛查，因疫苗不能预防所有高危HPV亚型。保持良好的生活习惯，包括性行为、戒烟、增强免疫力等，有助于进一步降低宫颈癌风险。接种前应咨询医生，根据年龄、健康状况、疫苗供应情况等综合选择。已完成四价疫苗接种者，若符合条件可补种九价疫苗以扩大保护范围，但需间隔至少12个月。
