南京治疗肾结石比较好的医院有江苏省人民医院、南京鼓楼医院、东部战区总医院、南京市第一医院、南京医科大学第二附属医院等。其中，江苏省人民医院泌尿外科设备，拥有多套体外冲击波碎石机和输尿管软镜系统，年手术量位居全省前列。南京鼓楼医院泌尿外科在微创治疗方面经验丰富，可开展经皮肾镜、输尿管镜等各类结石手术。东部战区总医院在复杂肾结石的综合治疗方面具有特色，尤其擅长感染性结石的处理。
1.江苏省人民医院
江苏省人民医院泌尿外科是江苏省临床重点专科，在肾结石诊疗方面具有显著优势。科室配备德国多尼尔体外冲击波碎石机、奥林巴斯电子输尿管软镜等设备，能够开展各种复杂性肾结石的微创治疗。年完成结石手术超过2000例，其中经皮肾镜手术成功率保持在95%以上。医院还设有结石成分分析实验室，为患者提供个性化的预防方案。门诊实行预约制，缩短患者等候时间。
2.南京鼓楼医院
南京鼓楼医院泌尿外科在肾结石微创治疗领域处于地位。科室常规开展输尿管软镜钬激光碎石术，对2cm以下肾结石具有创伤小、恢复快的优势。针对复杂肾结石，采用多通道经皮肾镜技术，提高清石率。医院引进了新一代超声定位系统，显著提升穿刺度。术后配备专业的康复团队，指导患者饮食调整和药物预防。急诊24小时提供结石急性发作的镇痛和引流治疗。
3.东部战区总医院
东部战区总医院泌尿外科在感染性肾结石治疗方面经验丰富。科室建立了一套完善的结石合并感染处理流程，包括术前抗生素使用规范、术中低压灌注和术后感染监测。拥有独立的结石细菌培养实验室，可快速鉴定致病菌。对于鹿角形结石，采用分期手术策略降低手术风险。医院还开展代谢评估门诊，帮助患者查找结石成因。病房配备专门的结石患者健康教育室。
4.南京市第一医院
南京市第一医院泌尿外科设有结石专病门诊，提供一站式诊疗服务。科室引进了瑞士第四代EMS碎石清石系统，能同步完成碎石和取石操作。针对儿童肾结石，采用超细经皮肾镜技术，小通道仅1.8mm。医院建立了结石患者随访数据库，定期提醒复查并跟踪预后情况。日间手术中心可完成简单结石的当日手术，节省住院时间。药学部配备专业临床药师指导结石预防用药。
5.南京医科大学第二附属医院
南京医科大学第二附属医院泌尿外科在肥胖患者肾结石治疗方面具有特色。科室配备加长型手术器械和特殊体位架，为BMI>30的患者提供的手术方案。采用超声联合X线双重定位技术，提高穿刺成功率。针对胱氨酸结石等特殊类型，开展药物溶解辅助治疗。医院设有结石预防研究中心，提供24小时尿液成分检测服务。手术室配备恒温灌注系统，维持术中肾盂低压状态。
