国家肾脏疾病临床医学研究中在中国肾脏病领域，南京大学医学院附属金陵医院肾脏病研究所具有特殊的地位。更多的人则视它为中国肾脏病的“梅奥诊所”（MayoClinic）。
作为中国肾脏病临床专科的典范，将肾脏病临床、专病门诊、血液净化、肾移植和基础研究有机地整合为一体，无论是其医疗和学术水平、学科规模、设备装置、综合实力、人才梯队，还是国际影响都是全国本专业具有特色的肾脏病临床治疗和研究中心之一。在国内同领域中，没有一个单位具有研究所目前所拥有的医疗项目和技术水平。
肾脏病研究所拥有专病化的专科门诊、临床治疗中心、肾活检诊断中心、血液净化中心、腹膜透析中心、肾移植中心、肾脏病重症监护病房（RICU）、移植病房及肾脏病重点实验室。是目前全球为数不多集上述功能为一体的临床专科。
普通外科
普通外科研究所设有肠瘘组、重症监护组、胃肠组、肝胆组、肠移植组、肿瘤组、胰腺组、血管组、营养组、甲乳组、腔镜组、护理组等专业组，还设有实验室、营养支持室和资料室。
普通外科研究所是国家、江苏省重点学科（实验室），南京大学博士学位授权学科，南方医科大学博士研究生联合招生点，国家博后工作流动站。是国家卫生部临床药理基地（营养支持专业），胃肠外科重点实验室。
在黎介寿院士的领导下，学科立足于医学发展前沿，融医疗、教学与科研为一体，逐渐形成为“具有的师资队伍、的教学条件、的教学质量和的教改成果的国内的医学创新人才培养工作的示范点”。
