真菌性肺炎主要由曲霉菌、隐球菌、念珠菌等致病性真菌感染引起，具体诱因包括长期使用免疫抑制剂、慢性肺部疾病、艾滋病等免疫功能低下状态、职业性真菌暴露以及环境因素影响。
糖皮质激素、化疗药物等免疫抑制剂会显著削弱机体免疫功能，导致肺部对真菌的清除能力下降。器官移植术后患者需长期服用他克莫司等抗排异药物，其真菌性肺炎发病率较常人明显增高。这类患者感染初期可能仅表现为低热、干咳等非特异性症状，容易延误诊治。
慢性阻塞性肺疾病、支气管扩张等结构性肺病患者，其呼吸道防御功能受损，真菌更易在支气管树定植。特别是长期使用广谱抗生素的肺病患者，呼吸道菌群失调后可能继发念珠菌感染。胸部CT常显示原有病变基础上出现新发浸润影或空洞形成。
CD4+T淋巴细胞计数低于200个/μL的艾滋病患者是隐球菌肺炎的高危人群。新型隐球菌可通过吸入鸽粪中的孢子感染肺部，进而血行播散至中枢神经系统。此类患者起病隐匿，可能出现头痛伴肺部磨玻璃影等不典型表现。
农业工作者、园艺师等职业人群在接触霉变谷物、腐烂植被时，可能吸入大量曲霉菌孢子。曲霉菌在肺内形成菌丝后可侵袭血管，导致咯血等血管侵袭性表现。职业防护不足时，短期高浓度孢子暴露即可引发急性过敏性肺炎。
潮湿密闭的居住环境容易滋生毛霉菌等条件致病菌，空调系统污染也可能传播嗜热放线菌。建筑工地拆迁时扬起的灰尘常含有隐球菌，免疫正常者吸入后多形成无症状肺部结节，但免疫功能受损者可能进展为活动性感染。
预防真菌性肺炎需加强高危人群防护，艾滋病患者应定期监测CD4细胞水平，慢性肺病患者需避免滥用抗生素。职业暴露者作业时应佩戴N95口罩，居家环境保持通风干燥。出现持续咳嗽、发热等症状时应及时进行血清学检测和胸部影像检查，确诊后需规范使用两性霉素B、伏立康唑等抗真菌药物，治疗周期通常需要数月至半年。日常可适当补充优质蛋白和维生素A增强呼吸道黏膜防御力，但切忌自行服用免疫增强类药物。
