伪膜性肠炎患者可遵医嘱使用地衣芽孢杆菌活菌胶囊、双歧杆菌三联活菌散、枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊、酪酸梭菌活菌片、布拉氏酵母菌散等微生物制剂辅助治疗。伪膜性肠炎多与艰难梭菌感染相关，需结合抗生素治疗及肠道菌群调节。
1、地衣芽孢杆菌活菌胶囊
地衣芽孢杆菌活菌胶囊可通过拮抗致病菌生长、调节肠道微生态平衡改善伪膜性肠炎症状。该制剂对艰难梭菌有一定抑制作用，适用于抗生素相关性腹泻的辅助治疗。使用期间需避免与抗菌药物同服，建议间隔2小时以上。
2、双歧杆菌三联活菌散
双歧杆菌三联活菌散含长型双歧杆菌、嗜酸乳杆菌和粪肠球菌，能直接补充肠道有益菌，竞争性抑制艰难梭菌定植。该制剂可缓解伪膜性肠炎导致的腹胀、水样便，需冷藏保存以保证活菌活性，温水冲服效果更佳。
3、枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊
枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊含枯草杆菌和肠球菌，可在肠道内产生抗菌物质抑制病原菌繁殖。肠溶设计确保活菌直达肠道发挥作用，适用于伪膜性肠炎伴发的肠道菌群失调，需整粒吞服避免破坏肠溶包衣。
4、酪酸梭菌活菌片
酪酸梭菌活菌片代谢产生的酪酸可直接营养结肠上皮细胞，修复伪膜性肠炎导致的肠黏膜损伤。该制剂对艰难梭菌毒素具有中和作用，能减少炎症性腹泻次数，建议餐后服用以降低胃酸对活菌的影响。
5、布拉氏酵母菌散
布拉氏酵母菌散为真菌类微生物制剂，不被抗生素杀灭，可与抗艰难梭菌药物联用。其通过增强肠道屏障功能、调节免疫反应减轻伪膜性肠炎症状，需注意对酵母过敏者禁用，溶解时水温不超过40℃。
伪膜性肠炎患者使用微生物制剂期间应保持低渣饮食，避免辛辣刺激及高脂食物加重肠道负担。注意补充电解质溶液预防脱水，便后清洁会阴部防止皮肤刺激。治疗期间严格遵医嘱调整抗生素与益生菌的用药间隔，定期复查粪便常规及艰难梭菌毒素检测。若出现持续发热、血便或腹痛加剧需立即就医。
