链球菌肾小球肾炎预后通常较好，多数患者经规范治疗后肾功能可完全恢复。预后差异主要与病理类型、治疗时机、并发症控制等因素相关。
急性链球菌感染后肾小球肾炎患者若早期接受抗生素治疗并控制感染，同时配合卧床休息及低盐饮食管理，水肿和高血压症状多在1-2周内缓解，尿液检查异常通常在3-6个月恢复正常。儿童患者较成人更易获得良好预后，极少进展为慢性肾病。病理改变以毛细血管内增生为主者，肾小球滤过功能多在6-12个月内逐步恢复。
少数伴有新月体形成或广泛肾小球硬化的重症患者可能出现持续性蛋白尿或血尿，肾功能恢复需更长时间。合并高血压脑病或急性肾衰竭者需进行短期透析支持，这类患者后期存在慢性肾脏病风险。老年患者或治疗延迟超过3周者，可能遗留轻度肾小球滤过率下降，需长期监测尿常规和肾功能指标。
建议康复期每3-6个月复查尿常规、血压和血肌酐，保持每日摄盐量低于5克，避免使用肾毒性药物。出现新发水肿或尿量减少应及时就诊，妊娠前需进行肾功能评估。适度进行步行、游泳等有氧运动有助于改善肾脏血液循环，但应避免剧烈运动导致蛋白尿加重。
