南京治疗甲状腺癌比较好的医院有江苏省人民医院、南京鼓楼医院、东部战区总医院、江苏省肿瘤医院、南京市第一医院等。其中江苏省人民医院作为全省综合实力强的三甲医院，其甲状腺外科年手术量超千例；南京鼓楼医院拥有独立的甲状腺疾病诊疗中心，配备达芬奇机器人手术系统；东部战区总医院在甲状腺癌的微创治疗领域具有显著优势，开展经口腔镜甲状腺手术等特色项目。
1.江苏省人民医院
江苏省人民医院甲状腺外科是国家临床重点专科，开设甲状腺癌多学科联合门诊，拥有超声引导下细针穿刺、术中神经监测、纳米碳示踪等核心技术。医院年完成甲状腺癌手术1200余例，其中复杂病例占比35%，开展全腔镜手术、侧颈淋巴结清扫等高难度术式。配备有3.0T磁共振、PET-CT等设备，建立从筛查、诊断到术后随访的全流程管理体系，五年生存率达到国内水平。
2.南京鼓楼医院
南京鼓楼医院甲状腺外科是江苏省开展机器人甲状腺手术的单位，拥有独立的甲状腺癌诊疗病区。医院创新应用术中喉返神经监测技术，将神经损伤率控制在0.5%以下。针对晚期甲状腺癌患者，开展靶向治疗联合放射性碘治疗的综合方案，建立分子病理检测平台实现分型。年手术量超过800台，微创手术比例达60%，其中经口入路手术量居华东地区前列。
3.东部战区总医院
东部战区总医院普外科甲状腺专业组在甲状腺癌诊治方面具有军内水平，特别擅长甲状腺癌合并纵隔淋巴结清扫的复杂手术。医院配备有术中快速病理诊断系统，可实现半小时内明确病理性质。创新开展经锁骨下入路腔镜手术，解决传统手术颈部疤痕问题。针对放射性碘治疗患者，建有符合国家标准的核素治疗病房，配备SPECT/CT等核医学专用设备。
4.江苏省肿瘤医院
江苏省肿瘤医院头颈外科专注甲状腺恶性肿瘤诊疗，建立甲状腺癌专病数据库，累计病例数超5000例。医院拥有省内的甲状腺癌放射治疗专科，开展调强放疗联合靶向治疗新技术。病理科具备甲状腺癌分子检测能力，可进行BRAF、TERT等基因检测指导治疗。针对晚期患者提供多学科联合诊疗服务，年开展甲状腺癌手术600余例。
5.南京市第一医院
南京市第一医院普外科甲状腺组开展甲状腺癌标准化诊疗，配备高清腔镜系统和超声刀设备。医院设立甲状腺结节专病门诊，应用TI-RADS分级系统提高早期诊断率。在甲状腺癌术后管理方面，建立包括内分泌调节、骨代谢监测在内的全程随访体系。年完成甲状腺手术400余例，其中甲状腺癌手术占比45%，开展颈部无瘢痕的腋窝入路腔镜手术。
