自闭症的形成原因是什么如下：
1、新陈代谢疾病：如苯酮尿症等先天的新陈代谢障碍，造成脑细胞的功能失调和障碍，会影响脑神经讯息传递的功能，而造成儿童自闭症。
2、遗传因素：部分患儿与遗传因素有关，遗传因素对孤单症的作用已趋于明确，患本病的儿童同胞中有2%～6%患本病，单卵双生子同病率高。
3、怀孕期间的病毒感染：在怀孕期间窘迫性流产等因素而造成婴儿大脑发育不全，早产、难产、新生儿脑部受伤，以及在婴儿期患上脑炎、脑膜炎等疾病造成脑部伤害，都可能会增加罹患儿童自闭症的机会。
4、免疫功能异常：部分患儿发病与免疫功能异常有关，如有免疫功能的淋巴细胞数量减少，活性减低，抵抗感染的功能下降。
5、神经递质：儿童自闭症与神经递质密切相关。有研究资料，认为中枢神经系统5-羟色胺和(或)多巴胺活性下降。伴有下丘脑功能障碍则可产生自闭症。
