大三阳可见于急性乙肝和慢性乙肝，两者的治疗及预后情况有所不同。
对于急性乙肝大三阳患者来说，大部分是可以康复的。如果感染乙肝病毒时，患者免疫功能正常且年龄在5岁以上，很多人能够完全清除病毒，并不容易变成乙肝病毒携带。据统计，急性乙肝感染所导致的大三阳患者中，60%-90%可以完全康复。然而，如果感染的年龄是婴幼儿，或者感染时身体免疫功能很差、有很多合并症，就容易变成慢性乙肝病毒携带。
慢性乙肝大三阳患者难以完全，但可以通过规范治疗使病情长期处于稳定状态。目前的治疗目标主要包括乙肝病毒DNA转阴、肝功能恢复正常以及大三阳转为小三阳。虽然有少数慢性乙肝大三阳患者约5%以下可痊愈，或者经过积极的抗病毒治疗后，会出现HBV-DNA下降直至检测不到的水平，转氨酶水平也能够恢复正常，甚至发生HBeAg血清学的转换，即大三阳转变为小三阳，但好的结果即发生表面抗原的血清学转换，也就是表面抗原消失、表面抗体出现的几率比较小。多数患者大三阳变为小三阳是目前较好的治疗结果。
目前，核苷类似物主要用于抗病毒药物治疗大三阳，患者需要结合肝功能和乙肝病毒DNA判断检查结果，在医生的指导下进行规范治疗。虽然乙肝大三阳目前难以完全，但通过积极的治疗和管理，可以控制病情稳定，提高患者的生活质量。
