病毒感染是肝硬化常见的病因之一。其中乙肝病毒感染是肝硬化的首要病因，如北京友谊医院专家透露，我国80%左右的肝硬化、肝癌患者都源自乙肝病毒感染。乙肝病毒携带者如果病毒处于不断复制阶段，就可能导致患者肝脏组织逐渐受损，发展成慢性乙型肝炎，每年5%至10%可能会发展成肝硬化。丙肝病毒慢性感染也可引起病毒性肝硬化，一般是由乙肝病毒或丙肝病毒慢性感染引起的一种慢性弥漫性的肝损伤，有广泛的肝细胞的坏死、残存肝细胞结节性再生、结缔组织增生以及纤维隔的形成，导致肝小叶的结构破坏或假小叶的形成，从而肝脏逐渐变形、变硬而发展为肝硬化。
酒精也是引发肝硬化的重要因素。在国外，尤其是一些欧美国家，长期大量饮酒导致酒精性肝硬化很常见。酒精性肝硬化患者早期一般无特异性症状和体征，若肝细胞炎症损伤较重，可出现食欲不振、脘腹胀满、倦怠、乏力等表现。随着病情发展，可出现肝硬化失代偿表现，如消化道症状常见，包括食欲不振、恶心、厌食油腻等，还可能出现大量腹水、面色晦暗、蜘蛛痣、肝掌等表现，男性乳房发育，女性月经不规律甚至闭经等，症状较重者甚至合并上消化道出血、肝性脑病等。
自身免疫性肝炎也可发展成肝硬化。自身免疫性肝硬化是由于自身免疫性肝炎所导致的肝硬化，是由自身免疫反应介导的慢性进行性肝脏炎性病变，组织学以淋巴细胞、浆细胞浸润为主，常伴有其他自身免疫性疾病。自身免疫性肝病发展成肝硬化在临床上主要有药物治疗及手术治疗，而肝脏移植手术是晚期唯一的治疗方式。
先天遗传性疾病也可能引发肝硬化，比如一些代谢引起的疾病可以导致肝硬化。
长期用药也可能导致药物性肝硬化。临床上常见的药物性肝损伤可能会快速进展至肝硬化，如外用药物引起的药物性肝损伤病例，ALT始终波动在100U/L左右，虽然一直接受保肝治疗，但半年内迅速进展至肝硬化、门脉高压。一种严重到能致死的肝病——急性肝衰竭主要的病因是中草药。在全国16家大型医院的药物性肝损伤病例中，中草药占致病因素的20%。3家大型专科医院的数据表明，超过一半的药肝病例跟中药相关。
