甲状腺结节可能会自行消失，但概率较低。甲状腺结节是否消失取决于结节性质、大小以及个体差异等因素。多数情况下良性小结节可能随着时间推移缩小或稳定，恶性结节或较大结节通常需要医疗干预。
甲状腺结节自行消失多见于体积较小的囊性结节或炎症性结节。囊性结节内部为液体成分，可能因液体吸收或破裂后逐渐消退。亚急性甲状腺炎等炎症性疾病伴随的结节，在炎症消退后结节可能随之减小或消失。部分青春期或妊娠期出现的生理性结节，在激素水平稳定后也可能自行缓解。
实性结节尤其是直径超过10毫米的结节较少自然消失。甲状腺腺瘤等良性肿瘤性结节通常保持稳定或缓慢增长。甲状腺癌等恶性结节具有持续增殖特性，未经治疗不会消退。存在钙化、血流丰富或边界不清等恶性特征的结节，更需警惕其进展可能。桥本甲状腺炎等自身免疫疾病伴随的结节，可能随甲状腺组织纤维化而长期存在。
发现甲状腺结节应定期复查甲状腺超声，监测结节大小和特征变化。避免过度摄入高碘食物如海带紫菜，保持规律作息和情绪稳定。若出现结节短期内迅速增大、声音嘶哑或颈部淋巴结肿大等症状，须及时就诊内分泌科或甲状腺外科。
