自身免疫性甲状腺疾病的严重程度因人而异，多数患者通过规范治疗可控制病情，少数可能出现严重并发症。这类疾病主要包括桥本甲状腺炎和格雷夫斯病，与免疫系统攻击甲状腺组织有关。
桥本甲状腺炎通常进展缓慢，早期可能仅有甲状腺肿大或轻度甲减症状，如疲劳、怕冷、体重增加等。通过左甲状腺素钠片替代治疗，多数患者甲状腺功能可维持在正常范围。格雷夫斯病则以甲亢为主要表现，可能出现心悸、多汗、体重下降等症状，抗甲状腺药物如甲巯咪唑片、丙硫氧嘧啶片可有效控制症状。部分患者可能出现甲状腺相关眼病，表现为眼球突出、视力改变，需眼科协同治疗。
未经控制的格雷夫斯病可能引发甲状腺危象，表现为高热、心律失常甚至昏迷，属于内分泌急症。长期未治疗的桥本甲状腺炎可能导致粘液性水肿，出现皮肤肿胀、声音嘶哑等症状。妊娠期甲状腺功能异常可能影响胎儿神经系统发育，需密切监测。极少数桥本甲状腺炎患者可能合并甲状腺淋巴瘤。
建议患者定期监测甲状腺功能指标，包括促甲状腺激素、游离甲状腺素等。日常需保持均衡饮食，桥本甲状腺炎患者可适当增加硒元素摄入，格雷夫斯病患者应避免高碘食物。出现心悸加重、持续乏力、明显体重变化等症状时应及时复诊。规律作息和适度运动有助于维持免疫系统平衡，但甲亢未控制时需避免剧烈运动。
