近视眼激光手术可能存在后遗症，但多数属于暂时性且可控。术后常见干眼、眩光等轻微不适，极少数可能出现角膜混浊或视力回退等需干预的情况。
近视眼激光手术后早期可能出现眼部干涩、异物感，与术中角膜神经暂时性损伤有关，多数在1-3个月内逐渐缓解。部分患者夜间出现眩光或光晕现象，尤其在暗光环境下，这与瞳孔大小和切削区光学特性相关，通常6个月左右适应。术后早期视力波动也较常见，属于角膜愈合过程的正常反应。少数患者可能出现角膜上皮下雾状混浊，表现为视物模糊，轻度者可通过药物控制，重度需二次处理。极个别案例因个体愈合差异出现矫正不足或过矫，需评估后补充增强手术。
术后严重并发症如角膜扩张、感染性角膜炎等发生概率极低，多与术前筛查疏漏或术后护理不当相关。圆锥角膜体质者若未严格排除可能诱发角膜结构异常。术中角膜瓣相关并发症如游离瓣、纽扣瓣等随着飞秒激光应用已大幅减少。长期随访数据显示，规范操作下性视力损害风险低于百分之一。
建议术前完成角膜地形图、眼压测量等全面检查，排除手术禁忌证。术后严格遵医嘱使用人工泪液和抗生素滴眼液，避免揉眼及游泳。定期复查有助于早期发现异常，出现持续眼痛或视力骤降需立即就医。保持良好用眼习惯可延缓视力回退，高度近视者仍需警惕视网膜病变风险。
