链球菌感染控制后肾炎可能好转，但部分患者仍需长期治疗。链球菌感染后肾小球肾炎的预后与病理类型、治疗时机及个体差异有关，部分患者可完全康复，部分可能进展为慢性肾炎。
急性链球菌感染后肾小球肾炎在感染控制后，多数患者肾功能和尿检指标会逐渐恢复正常。早期规范使用抗生素清除链球菌感染，配合卧床休息、低盐饮食等支持治疗，有助于减轻肾脏炎症反应。儿童患者预后通常优于成人，80%以上患儿在6个月内尿蛋白和血尿消失。
少数患者可能转为慢性病程，尤其存在基底膜持续损伤或免疫复合物沉积时。这类患者需要长期监测血压、肾功能和尿蛋白，必要时使用血管紧张素转化酶抑制剂或免疫抑制剂。病理类型为新月体肾炎者，肾功能恢复概率显著降低，可能需肾脏替代治疗。
建议链球菌感染后肾炎患者定期复查尿常规、肾功能和血压，即使症状消失也应随访1-2年。日常注意预防呼吸道感染，避免使用肾毒性药物，保持适度水分摄入。出现水肿、尿量减少或血压升高时需及时就医。
