钡灌肠和肠镜的疼痛感受因人而异，钡灌肠的不适感通常集中在腹胀和排便刺激，肠镜则可能因肠道牵拉或充气引发短暂绞痛。两种检查的耐受度与患者肠道敏感性、操作技术及心理状态密切相关。
钡灌肠通过导管向直肠注入硫酸钡造影剂，检查过程中需要反复改变体位以使造影剂均匀分布，可能引发明显的腹胀感和便意。部分患者对造影剂温度敏感可能出现肠道痉挛，但整个过程无须麻醉，检查后通过排便可快速缓解不适。肠镜需将软管经肛门插入至回盲部，充气扩张肠道时可能产生牵拉痛，尤其在肠道转弯处或存在粘连时痛感更明显。无痛肠镜通过静脉麻醉可完全消除操作痛苦，但清醒状态下检查者对疼痛的敏感度差异较大，肠道准备不充分或操作时间延长可能加剧不适。
钡灌肠的疼痛多源于造影剂对肠壁的压力刺激，肠道炎症或憩室患者痛感可能加重，但通常不会超过轻度至中度疼痛。肠镜的疼痛风险集中在肠道解剖异常者，如肠粘连、肠扭转或既往腹部手术史患者，普通人群在医生熟练操作下多数仅感到轻微钝痛。两种检查后均可能出现短暂腹痛或肛门不适，肠镜检查后因残留气体导致的腹胀通常1-2小时消退。
检查前充分沟通可显著降低焦虑相关的痛觉敏感，钡灌肠前3日需低渣饮食并服用缓泻剂清洁肠道，肠镜前需更严格的清肠准备。对疼痛耐受差或存在肠道病变高风险者，优先考虑无痛肠镜可兼顾检查准确性与舒适度。术后建议适量饮水促进造影剂或气体排出，避免立即进食刺激性食物。
