卵巢囊肿手术后是否影响生育需根据手术方式和囊肿性质决定，多数情况下不会显著影响生育功能，但少数复杂手术可能对卵巢储备功能造成一定影响。
对于单纯性囊肿或良性肿瘤的腹腔镜微创手术，通常仅切除囊肿并保留正常卵巢组织，术后卵巢功能可较快恢复。这类手术对卵泡储备和激素分泌干扰较小，月经周期多在1-3个月内恢复正常。研究显示约80%患者在术后6个月可自然受孕，术后妊娠率与普通人群无显著差异。关键需确认对侧卵巢功能正常且输卵管通畅，建议术后通过超声监测卵泡发育情况。
当囊肿体积过大、存在恶性倾向或发生扭转破裂时，可能需进行患侧卵巢切除或部分卵巢组织切除。此类情况可能减少卵泡数量，导致卵巢储备功能下降，特别是双侧卵巢受累时。术后可能出现暂时性月经紊乱，需3-6个月评估激素水平。对于有生育需求者，建议在医生指导下进行生育力保存或尽早备孕，必要时可考虑辅助生殖技术干预。
术后应定期复查妇科超声和性激素六项，建立规律月经周期后可通过基础体温测定监测排卵。备孕期间保持均衡饮食，适当补充维生素E和辅酶Q10等抗氧化剂，避免剧烈运动导致卵巢扭转。若术后1年未孕需进行生育评估，包括输卵管造影和男方精液检查等。
